在一座遭轰炸的矿山地底七百米处，金田等三名矿工发现一具全身绿色、长着三只角和三只眼睛的奇异尸体。帆村庄六推测其从天上掉落，且与宇宙射线有关。特别刑事调查队赶来调查，解剖时尸体却突然复活逃走。此后，白根村出现离奇的透明之壁事件，阻挡人们前行。帆村因提出宇宙战争的观点，虽受质疑但也获得一些人的支持。龙造寺兵曹长在平流层飞行时失踪，山岸中尉向帆村求助。为探寻真相，他们组建宇宙战争研究班，驾驶喷气艇进入平流层侦察，却遭遇“魔幻空间”，被绿色的咪咪族囚禁。他们将如何逃脱？咪咪族又有何目的？