《资本主义起源新论》汇集了作者长达数十年的资本主义理论研究的成果。作者分别从农民与欧洲资本主义关系、欧洲文明与资本主义关系，以及中西比较视野下的资本主义起源研究三个方面，详细描述了资本主义产生、发展的历史过程及其原因。与以往的资本主义研究相比，本书以经济―社会史的理论方法为分析框架，重视经济因素，同时重视观念、法律政治和思想文化传统等非经济因素，突破了中国史和世界史的分野，从整体上对16―18世纪的中、西方社会进行长时段、全方位的比较研究，拓宽了历史学研究领域。更值得关注的是，探究资本主义起源，作者提出主体权利的新视角，具有思想张力和启迪意义。